La premisa de la pregunta es incorrecta. Si bien es probable que sea cierto que la mayoría de los descubrimientos científicos ocurren dentro de la academia, prácticamente no ocurre innovación allí. (Ni siquiera puedo pensar en una innovación que tuvo lugar dentro de la academia).
La innovación es la introducción exitosa de algo nuevo y útil, y no es trabajo de la academia hacer eso.
Google es un buen ejemplo. El algoritmo de PageRank se desarrolló dentro de la academia, pero Google Search fue presentado por una empresa.
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La innovación requiere asumir riesgos, capital, emprendimiento, ventas. gestión y cualquier cantidad de otras tareas y recursos relacionados con los negocios que generalmente no están disponibles dentro de las instituciones académicas. Quizás lo más importante es que las habilidades que necesita para tener éxito como académico son completamente distintas de las que necesita para crear una startup.
No es casualidad que varios de los empresarios modernos más famosos (Gates, Page & Brin, Zuckerberg, Dell, …) abandonaron la academia para seguir sus planes de innovación.